Aitana Ares^1,2, Joana Pereira¹, Catarina Coelho¹, Eva Garcia^1,2, Joana Costa^1,2*, Igor Tiago¹*

1. Universidade de Coimbra, Centro de Ecologia Funcional, Departamento de Ciências da Vida, Calçada Martim de Freitas, 3000-456 Coimbra, Portugal.
2. Laboratório de Fitossanidade, Instituto Pedro Nunes, 3030-199 Coimbra, Portugal

A produção internacional de kiwis tem sido afetada negativamente devido à doença pandémica provocada pela bactéria de Pseudomonas syringae pv. actinidiae (Psa). Sabe-se que as condições abióticas e o género das plantas são fatores que influenciam o desfecho e consequências da doença. De modo a determinar o impacto da doença por Psa no microbioma das plantas de kiwi (macho e fêmea), dois tipos de metodologias foram usadas em amostras de folhas de plantas saudáveis e plantas doentes provenientes de cultura biológica. Com a metodologia independente de cultivo determinou-se a diversidade microbiana pela sequenciação em massa da região V5-V6 do gene codificante do 16S rRNA em duas ocasiões temporais distintas: Primavera e Outono. A segunda metodologia, dependente de cultivo, permitiu determinar a diversidade bacteriana através da identificação das culturas recuperadas das diferentes amostras. A metodologia independente de cultivo identificou cinquenta unidades taxonómicas operacionais (OTU) distribuídas por 5 filos, 14 famílias e 23 géneros. A diversidade bacteriana determinada foi partilhada por folhas de plantas fêmeas e macho, e demonstrou ser profundamente afectada por alterações sazonais. Em ambos os géneros observou-se um aumento substancial da abundância relativa do género Methylobacterium no Outono. A presença de Psa contribuiu para alterações profundas na estrutura da diversidade bacteriana das folhas, observando-se uma redução da abundância relativa de géneros anteriormente maioritários em folhas de plantas saudáveis, i.e. Hymenobacter, Sphingomonas e Massilia. O impacto da doença na diversidade estrutural do microbioma das folhas foi menos pronunciado nas folhas de plantas macho em ambas as estações. Um total de 455 isolados, agrupados por 135 grupos RAPD, foram distribuídos taxonomicamente por cinco classes e 58 espécies. Algumas das espécies isoladas correspondiam a populações identificadas pela metodologia independente de cultivo. Outras foram apenas identificadas através do esforço de cultivo. Em ambas as abordagens foram detectados géneros já descritos como tendo o potencial de agir como antagonistas ou como promotores dos mecanismos de defesa da planta. Ao garantir o acesso ao organismo vivo, a metodologia de cultivo, permite também o seu estudo e testagem, e determinar o potencial de cada cultura para ser utilizado no controlo de doenças como parte de uma metodologia ambientalmente amigável e economicamente sustentável.

Financiamento: Trabalho realizado no âmbito da Ação 1.1 Grupos Operacionais “I9K – InovKiwi – Desenvolvimento de estratégias que visem a sustentabilidade da fileira do kiwi através da criação de um produto de valor acrescentado” promovida pelo PDR2020 e co-financiada pelo FEADER, no âmbito do Portugal 2020. Aitana Ares e Igor Tiago agradecem o financiamento do Projecto CULTIVAR (CENTRO-01-0145-FEDER-000020), co-financiado por o Programa Operacional Regional Centro 2020, Portugal 2020, e a União Europeia, através do Fundo Europeu de Desenvolvimento Regional (FEDER).